Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh12Q5RJH3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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