Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtp3Q5QGU6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms