Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5431Q5NCB3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms