Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ecm2Q5FW85 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ecm2Q5FW85 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms