Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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