Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Rtl5Q5DTT4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Rtl5Q5DTT4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtl5Q5DTT4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms