Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Fam208bQ5DTT3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fam208bQ5DTT3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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