Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN45

UPF0691 protein C9orf116 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5BN45 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q5BN45 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5BN45 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5BN45 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms