Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpjQ569L8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CenpjQ569L8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CenpjQ569L8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms