Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms