Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms