Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pdp2Q504M2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdp2Q504M2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pdp2Q504M2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pdp2Q504M2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pdp2Q504M2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pdp2Q504M2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pdp2Q504M2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdp2Q504M2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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