Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3lQ4KL14 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms