Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxn3Q499D0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxn3Q499D0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms