Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2al1nQ497L1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms