Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc110Q3V125 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms