Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccdc185Q3V118 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc185Q3V118 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc185Q3V118 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc185Q3V118 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc185Q3V118 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc185Q3V118 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc185Q3V118 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc185Q3V118 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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