Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed1Q3V009 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms