Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnpc3Q3UZ01 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms