Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Pfdn4Q3UWL8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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