Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnga4Q3UW12 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms