Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fchsd2Q3USJ8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fchsd2Q3USJ8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms