Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28047Q3US59 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms