Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec31aQ3UPL0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms