Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrc4Q3UP24 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrc4Q3UP24 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms