Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm648Q3UJ22 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm648Q3UJ22 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm648Q3UJ22 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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