Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek10Q3UGM2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek10Q3UGM2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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