Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trafd1Q3UDK1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trafd1Q3UDK1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms