Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp25Q3U435 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp25Q3U435 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp25Q3U435 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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