Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gse1Q3U3C9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms