Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms