Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Palb2Q3U0P1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Palb2Q3U0P1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms