Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms