Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc69Q3TCJ8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms