Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hddc2Q3SXD3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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