Protein–RNA interactions for Protein: Q32NZ6

Tmc5, Transmembrane channel-like protein 5, mousemouse

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Length 967 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc5Q32NZ6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tmc5Q32NZ6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmc5Q32NZ6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms