Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms