Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd300lgQ1ERP8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms