Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptcd3Q14C51 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms