Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd9Q14BI7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Tdrd9Q14BI7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms