Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd2Q149F1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms