Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spata18Q0P557 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spata18Q0P557 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms