Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kndc1Q0KK55 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kndc1Q0KK55 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms