Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21bQ0HA38 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Ttc21bQ0HA38 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Ttc21bQ0HA38 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Ttc21bQ0HA38 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Ttc21bQ0HA38 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Ttc21bQ0HA38 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Ttc21bQ0HA38 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Ttc21bQ0HA38 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc21bQ0HA38 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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