Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pate4Q09098 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pate4Q09098 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms