Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700061G19RikQ08EE8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms