Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gata4Q08369 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms