Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms