Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms