Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms